Prétraitement des bases de données de réactions chimiques pour la fouille de schémas de réactions

Frédéric Pennerath 1 Géraldine Polaillon 2 Amedeo Napoli 3
3 ORPAILLEUR - Knowledge representation, reasonning
INRIA Lorraine, LORIA - Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications
Résumé : Un grand nombre de réactions chimiques sont aujourd'hui répertoriées dans des bases de données. Les chimistes aimeraient pouvoir fouiller les graphes moléculaires contenus dans ces données pour en extraire des schémas de réactions fréquents. Deux obstacles s'opposent à cela : d'une part la manière dont les chimistes représentent les réactions par des graphes ne permet pas aux techniques de fouille de graphes d'extraire les schémas de réactions fréquents. D'autre part les bases de données contiennent des descriptions de réactions souvent incomplètes, ambigues ou erronées. Le présent article décrit un processus de prétraitement opérationnel qui permet de filtrer, compléter puis transformer le contenu d'une base de réactions en des données fiables constituées de graphes abstraits répondant au problème de la fouille de schémas de réactions. Le processus place ainsi les bases de réactions à portée des techniques de fouille de graphes comme en attestent les résultats expérimentaux.
Document type :
Conference papers
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https://hal-supelec.archives-ouvertes.fr/hal-00276160
Contributor : Fabienne Munier <>
Submitted on : Monday, April 28, 2008 - 4:07:52 PM
Last modification on : Tuesday, July 9, 2019 - 11:58:02 AM

Identifiers

  • HAL Id : hal-00276160, version 1

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Citation

Frédéric Pennerath, Géraldine Polaillon, Amedeo Napoli. Prétraitement des bases de données de réactions chimiques pour la fouille de schémas de réactions. 8èmes journées Extraction et Gestion des Connaissances, Feb 2008, Sophia-Antipolis, France. pp.547-558. ⟨hal-00276160⟩

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